佐伯城
佐伯城（さいきじょう）は、大分県佐伯市にあった日本の城。江戸時代には佐伯藩の藩庁が置かれた。「さえき」と読むのは誤り。国の史跡に指定され、大分百景・ 続日本100名城（194番）に選定されている。
臼杵城
臼杵城（うすきじょう）は、大分県臼杵市にあった日本の城。城跡は国の史跡に指定されている。戦国時代、大友宗麟により臼杵城の前身となる「丹生島城（にうじまじょう）」が築かれ、大友氏の拠点となった。江戸時代には臼杵藩の藩庁が置かれた。 丹生島は北、南、東を海に囲まれ、西は干潮時に現れる干潟の陸地でつながるのみという天然の要害をなしていた。
高崎山城
高崎山城（たかさきさんじょう）は、大分県大分市の高崎山にあった日本の城。高崎城とも呼ばれる。
鶴崎城
鶴崎城（つるさきじょう）は、大分県大分市鶴崎にあった日本の城。大友氏家臣の吉岡氏の居城であった。
栂牟礼城
栂牟礼城（とがむれじょう）は、大分県佐伯市弥生（旧南海部郡弥生町）大字井崎上小倉にあった日本の城（山城）。大永年間（1521年-1528年）に佐伯惟治によって栂牟礼山に築かれたとされる。
時枝城
時枝城（ときえだじょう）は、大分県宇佐市下時枝にあった日本の城。宇佐神宮弥勒寺の寺務方であった時枝氏の居城。
永山城
永山城（ながやまじょう）は、大分県日田市丸山町にあった日本の城。小川氏築城時は丸山城（まるやまじょう）と呼ばれた。別名、豆田城（『豊城世譜』）、月隈城（つきくまじょう）ともいう。この「月隈城」の呼称については、『豊後国志』巻之八にみられる。以下は、日田陣屋を併記する。
日出城
日出城（ひじじょう）は、大分県速見郡日出町にあった日本の城。江戸時代を通して、木下氏が居城した。明治初期の府藩県三治制下において日出藩の藩庁が置かれた。
日田城
日田城（ひたじょう）は、大分県日田市北豆田慈眼山公園とその一帯（豊後国日田郡在田郷城内村）にあった日本の城。大蔵城、鷹城、高城ともいう。
真玉城
真玉城（またまじょう）は、大分県豊後高田市大村にあった日本の城。
妙見嶽城
妙見嶽城（みょうけんだけじょう）は、大分県宇佐市院内町香下（豊前国宇佐郡）の妙見岳山頂にあった日本の城。
鎧岳城
鎧岳城（よろいだけじょう）は、大分県豊後大野市大野町の鎧ヶ岳山にあった日本の城。
角牟礼城
角牟礼城（つのむれじょう）は、大分県玖珠郡玖珠町の角埋山（つのむれやま）にあった日本の城（山城）。弘安年間（1278年 - 1288年）に森朝通により築かれたとされる。国の史跡。
中津城
中津城（なかつじょう）または中津川城（なかつがわ（の）じょう）は、大分県中津市二ノ丁（豊前国中津）にあった日本の城。黒田孝高（如水）が築城し、細川忠興が完成させた。 大分県指定史跡。享保2年（1717年）からは、奥平家が居城としていた（中津藩も参照）。
日隈城
日隈城（ひのくまじょう）は、大分県日田市亀山町（きざんまち）（豊後国日田郡竹田村）にあった日本の城。
杵築城
杵築城（きつきじょう）は、大分県杵築市杵築にあった日本の城。城跡のうち麓の藩主御殿跡は大分県の史跡に指定されている。また、城郭があった台山地区と藩主御殿地区は、国の史跡に指定されている。
朝日嶽城
朝日嶽城（あさひだけじょう）は、大分県佐伯市宇目大字塩見園（豊後国海部郡）にあった戦国末期の日本の城（山城）。
府内城
府内城（ふないじょう）は、大分県大分市（豊後国府内）にあった日本の城（平山城）。大分城（おおいたじょう）、荷揚城（にあげじょう）、白雉城（はくちじょう）とも呼ばれる。